Метод Маскингам–Кюнжа – наиболее сложный из всех упомянутых выше методов. Как и метод Маскингам, на основе которого он разработан, метод Маскингам–Кюнжа основан на уравнении неразрывности, а также включает дифференциальную форму уравнения моментов.
Это приводит к большей физической обоснованности параметров K и х, при этом:

Вычисления по методу Маскингам–Кюнжа более длительные, и обычно выполняются на компьютере, с использованием метода конечных разностей. Этот метод не является строго линейным, так как он подразумевает пересчет параметров потока и динамических коэффициентов по времени и пространству на каждом шаге. В результате получаем физически обоснованный метод, вполне сравнимый с полными уравнениями неустановившегося потока, применяемыми при гидравлическом расчете гидрографа стока.
Основным ограничением метода Маскингам–Кюнжа является его несоответствие условиям быстрого увеличения водности, например, при прорывах дамб или быстроразвивающихся паводках. Для таких условий лучше подходят динамические методы, обсуждаемые в следующем разделе Гидравлический расчет гидрографа стока.